阜阳市医药科技工程学校开设护理、中药制药、制药技术应用、汽车运用与维修、工业机器人技术应用、动漫与游戏制作、作物生产技术、社会文化艺术等十四个专业，学校是一所由阜阳市人民政府批准改制的公办全日制普通中专学校，安徽省示范中等职业学校。
学校以“品能教育”为依托，深化产教融合、校企合作，培养具有综合职业能力的技术技能人才。学校先后被评为“全国零犯罪学校”、“全国国防教育先进校”、“安徽省文明单位”、“安徽省书法教育示范校”、“阜阳市平安校园”、“阜阳市职业教育先进单位”等。