阜阳市医药科技工程学校现有教职工202人，其中在编在岗164人，返聘1人，校聘专任教师19人，兼职教师18人，折合专任教师191人，专业课教师102人，双师型教师77人，高级讲师59人。现有62个教学班，全日制在校生3793人。学校现有图书资源总量13.35万册，报刊杂志128种，16个校内外实习实训基地。
学校以“品能教育”为依托，实施“三进教学”模式，即企业进校园、师傅进课堂、学生进车间；积极开展现代学徒制；实施中高职衔接人才培养，先后与阜阳职业技术学院、六安职业技术学院、安徽省林业职业技术学院联合举办“3+2”五年一贯制大专班；加强思想道德建设，形成了安全系列教育、国防教育、传统文化进校园等特色办学模式。